Najtrudniejszym problemem związanym z wykorzystaniem energetycznym wód jest ich zmineralizowanie. Cecha korzystna w uzdrowisku stanowi utrudnienie w energetyce. Powodem jest duży stopień mineralizacji, który powoduje odkładanie się związków wapnia w instalacjach grzewczych dlatego przed ich wprowadzeniem odmineralizowuje się je. Wody gorące mają także zastosowanie w celach rekreacyjnych. Przykładem jest ogrzewane w ten sposób kąpielisko w Jaszczurówce w Zakopanem. Wybudowanie dużego zespołu kąpielisk zasilanych z ujęć wód gorących planuje się w Poznaniu nad jeziorem Malta.